Ещё раз повторяю не было никаких значимых изменений в кириллице в ранний период, т.е. тот пласт что был получен Киевской Русью от болгарской письменной школы закончившей свою работу как раз в конце X в (к моменту начала христианизации Руси) оставался в относительной стагнации длительное время. Т.е. тексты скажем XI в. и XIII в. имеют минорные отличия. Серьезные изменения начались в куда более позднее время с учётом изоляции друг от друга различных территорий использовавших кириллицу. Если говорить о Руси то колоссальную роль сыграло исчезновение главенствующей роли Константинопольского патриархата который ранее связывал все народы (не только Руси) использовавшие кириллицу в один узел и выпадение западных земель Руси в орбиту католиков использовавших латиницу, но и этот процесс был вовсе не быстр (это не время интернета).
Нет никакой "истории Московии", я по крайне мере не слышал о такой. Северо-Восточные земли Руси (Залешская русь) + республики Новгорода и Пскова это не "Московия" (Московское княжество выдвинулось только в XIV в). В этих землях присутствовала масса княжеств (+ аж две республики) нередко люто враждовавшие с друг другом (к примеру на момент начал возвышения Московского княжества его главным врагом была Тверь, при этом ещё в конце XIV в. московские князья имели поддержку из той же Литвы от православных князей, чего только братья Полоцкие стоят).
Это всё минорные отличия ибо кириллица пребывала в векторе старославянского языка который был языком церкви на Руси, безусловно можно найти отличия в текстах что писал какой-нибудь посадник Васько Травина проживавший в Пскове и тексте купца проживавшего где-нибудь в Галиче, но всё это укладывалось в разницу диалектов и не более того (новгородцы к примеру сильно цокали), разница между самой кириллицей - минимальна.
Поздний период, "период изолированных территорий Руси" не имеет отношения ни к XI в. ни даже к XIII в. Позже (~ с конца XIV - начала XV в.) восточные славяне использовавшие кириллицу оказались разделены растущей империей турок, венграми, поляками и литовцами (довольно активными в регионе около 3-х столетий), +в этот же период началось окончательное сглаживание бывших племенных образований восточных славян и сращивание существовавших диалектов (иной раз весьма своеобразных) шёл процесс складывания народностей. На этом фоне некие различия в кириллице стали проявляться но в целом даже это было смехотворно вплоть до серьёзных реформ более поздних времён (XVIII в и позже). В том же XIV в. письменность была по сути единой не то что с западными землями Руси но и с теми же балканскими народами, болгарами, благо присутствовала постоянная миграция населения по Руси (археологи отмечают нередкие переселения населения с территории южнорусских земель - Киев, Чернигов и.т.д. подвергавшихся избиению кочевниками - на север Руси) включая высокопоставленных лиц церкви вместе с их администраций, к примеру метрополит Киевской Руси Киприан был выходцем из Болгарии, сидел сначала в Киеве при Владимире Ольгердовиче а позже переехал в Москву. Вплоть до тех пор пока Русь находилась в орбите Константинопольского патриархата (и его чиновничьего аппарата) связи не прерывались и никаких "довольно сильно менялась" никто себе не позволял, всё пребывало в конве местных диалектов и не более того, а уж церковные документы отрабатывались повсеместно на старославянском языке - языке церкви (церковные трактаты это не письмо Любавы с одной улицы Новгорода на другую кои писались на местных диалектах).